2008年4月19日下午三点十五分，位于米花区堂本音乐学院的练习室突然发生爆炸，正在室内的钢琴手连成岳彦和大提琴手水口样介当场死亡，小提琴手河边奏子则是被炸弹炸成重伤后被送进附近的医院抢救。
炸弹客坐在电脑前看完新闻后调出小提琴手河边奏子的资料“哼，河边奏子，你要恨，就恨恨自己的天赋吧，一切都是为了宁静的夜晚……”
案发一个星期后，放学后回到家里的毛利兰正在打电话“堂本一挥？”
“你有听过吧新一？”
“有啊，上星期有间音乐学院爆炸，他是那里的创始人对吧？”
柯南：应该是说，我和小羽毛正在现场勘查，我负责外围他负责里面，反正这围墙我也爬不上去。
毛利兰“他原本是一位有名的钢琴家，却突然改弹起管风琴，为了兴建新的音乐厅，还从德国的老教堂运来一台管风琴呢。”
柯南“我知道，听说巴哈曾经弹过那台管风琴对不对？”
”重点是我们可以去参加那座堂本音乐厅的落成音乐会哦，除此之外还能参观排练，全靠园子帮忙。”
“对喔，那座堂本音乐厅就是铃木集团负责兴建的。”
柯南注意到地上的碎片“钢琴的键盘？居然被炸飞到这么远的地方来。”
“一起去嘛新一，可以听到那把斯特拉迪瓦里兀斯名琴的演奏……”柯南正要回复毛利兰，结果发现一个老人出现在爆炸现场附近。
“你有在拉小提琴，不是想听一次现场演奏吗？”
柯南看见老人把手上的钢琴碎片给紧紧握在手里后上车：那个人是怎么回事？
毛利兰“你在听吗新一？”
“抱歉抱歉，刚好我正在忙着调查手上的案子，等下我告诉小羽毛让他代替我去吧。”
“不能挪出一点时间吗？排练是在后天。”
“很遗憾，我没办法去。”柯南拿出笔记记下车牌号。
“音乐会是在下星期二举行。”
“都给你说了，我要忙着查案子。”
“可是，你可能很快就查完了，我会请园子先帮你留票。”
“都说不用了，你就不用这么鸡婆了……可恶。”柯南不小心让笔记本掉在草地上。
“别这么鸡婆？”
柯南发现自己说错话“不是啦。”
坐在椅子上睡觉的毛利小五郎瞬间被毛利兰的怒气吓醒“是……你说的没错，反正我就是爱鸡婆，是个只会空手道的傻瓜！”
“我哪有那么说？”
“算了，反正就算听了斯特拉迪瓦里琴，新一你也不可能变成福尔摩斯。”
“你说什么？”
“因为你啊，是个超级无敌大音痴！”
柯南：小兰，你这臭妮子……
“你就好好加油吧，音痴名侦探……气死我了，我以后绝对不会再约那个推理狂了。”
“真是的……”柯南听到另一部手机在响。
“喂？”
毛利兰“柯南吗？你今天晚餐想吃什么？”
“那个？我想想看……”
“咖喱饭好吗？还是说你想吃别的？”
“就吃咖喱饭好了。”
“太好了，你这么乖真是让我省事不少呢……”毛利兰听到电话另一头传来喷嚏声。
“那是谁啊？”
柯南“是，是阿羽哥啦，我现在跟他在中华街买调料，他被辣椒面的味道呛到了。”
“这样啊，那早点回来喔。”
“好。”
“那再见。”毛利兰挂断电话。
“当我变成柯南的时候就有办法乖乖听话。”
一个非洲黑人出现在柯南身后把他吓一跳“你这找到什么了吗？”
“你谁啊？”
“你连我都认不出来吗？”
“小羽毛？”
“废话。”
“你这一身……”
“别提了，我只不过是打了个喷嚏，结果天花板上的灰就掉了下来糊了我一身，妈的……呸！”
“那你还挺倒霉啊。”
“废话！操……”
一段时间后，柯南一行人来到音乐厅里观看管风琴演奏家堂本一挥的排练，不止柯南一行人，目幕警官四人也来到音乐厅里观看排练，排练结束后掌声响起“太棒了太棒了，简直太完美了。”
“弹得真棒堂本先生，跟钢琴有着截然不同的魅力。”
毛利小五郎“真不愧是堂本一挥，好精彩的演奏。”
毛利兰“我在电视上看过那个人。”
铃木园子“嗯？”
“就是那个戴眼镜的。”
“啊，那个人是谱和匠先生，担任堂本先生的专属调音师长达三十五年，这次是担任堂本音乐厅的馆长。”
兄弟二人：那个人……
“现在面向我们的德国人名叫汉斯谬拉，是位管风琴调音师，别看他笑得那么开心，听说当初跟堂本先生磨合了好久。”
“在一旁担任翻译的则是堂本先生的儿子，也是位钢琴家，名叫弦也，他是这次公演的负责人。”
“再来呢，旁边的那两位女性，那两位是堂本先生的弟子。右边那位是堂本学院第九届毕业生，女高音歌手千草拉拉小姐，她旁边看起来有点神经质的那位则是同学院的第八届毕业生小提琴手山根紫音。”
苍天蓝羽“没记错的话她是被炸弹炸成重伤的河边奏子的替补吧？”
“没错没错，在爆炸发生的时候河边小姐的斯特拉迪瓦里琴恰巧送去调整而幸免于难，所以就借给紫音小姐演奏，然后坐在观众席第一排的则是……”
毛利兰“就是女高音秋庭伶子小姐吧？”
“也难怪你会认得她，因为她很有名嘛。”
堂本一挥“好了紫音，开始准备吧。”
“是。”
“就从第一首圣母颂开始。”
“是。”山根紫音走到舞台中间后开始拉小提琴。
秋庭伶子听到山根紫音拉的圣母颂后叹气“从你的状况看来，似乎还没有能力配合我的演奏嘛。”
堂本一挥“是啊，不好意思请你再等等。”
山根紫饮“对不起。”
高木警官“终于可以听到斯特拉迪瓦里琴的现场演奏了佐藤小姐。”
白鸟警官“老实说，我倒是比较喜欢阿玛蒂琴。”
佐藤警官“嘘！你们安静一点。”
山根紫音点头示意后堂本一挥开始演奏，等时机成熟后山根紫音开始拉小提琴合奏，本堂一挥停止弹奏“不行不行，一点都不像话嘛，你这一个星期都在干什么？”
山根紫音“对不起。”
铃木园子“哪里不对吗？”
毛利兰摇头“我觉得很完美啊。”
兄弟二人：不，她并没有拉出斯特拉迪瓦里琴应有的音色。
堂本一挥“从头来一次。”
山根紫音“是。”
堂本一挥再次开始弹奏，山根紫音等到时机成熟后开始拉小提琴合奏，结果小提琴的琴弦突然断掉，毛利小五郎突然坐起来“怎么了？发生什么事了？”
毛利兰“好像是小提琴的琴弦断了。”
山根紫音“对不起，我现在马上去换弦。”
堂本弦也“汉斯先生，你觉得音色的平衡如何呢？”
“关于音色平衡这方面应该没有什么问题。”
秋庭伶子起身离开“真是的，我今天还有练唱的机会吗？”
目幕警官“秋庭小姐，打扰你一点时间。”
“可以先让我去趟化妆室吧。”
目幕警官看见毛利小五郎走过来“毛利老弟？”
“关于爆炸案的嫌疑犯有头绪了吗？”
“还摸不着头绪呢。”
“犯案用的果然是c4炸弹。”
“对啊，还在现场找到了定时器，好像是设定在他们两人练习时引爆。”
“这么说这件案子果然是……”
“毛利老弟很抱歉，我不能在这种公开场合透露调查进度，尤其是在小孩子面前。”
“啊？小孩子？”毛利小五郎发现柯南在旁边偷听。
毛利小五郎给柯南的天灵盖上打出一个大包后把他拎到苍天蓝羽旁边“小羽毛，你替我看着他。”
苍天蓝羽看着脑袋上顶着大包的柯南：活该。
元太看着管风琴“好大喔。”
光彦“不光是巨大，还充满了美感。”
堂本弦也“很壮观对吧？”
步美“请问，管风琴是怎么发出声音的？”
“它的发声原理就跟你们在学校吹的直笛是一样的，你们看，上面排列了许多管子对吧？就像吹直笛一样，把空气送进那些管子里然后就可以发出声音了。”
光彦“是空气吗？”
元太“可是那些管子上并没有像直笛一样的笛孔啊。”
堂本弦也“没错，直笛是靠指头压住笛孔借以发出高低不同的声音，管风琴则是按下键盘与键盘相对于的管子就会发出声音，而且每一根管子都只能发出一种声音。”
步美“那些像按钮的东西是什么？”
“这个吗？这个叫音栓钮，只要拉出这些按钮，就能让琴发出各种不同的音色，比如，我把这个拉出来的话……”
元太“是小喇叭。”
堂本弦也再次拉出一个按钮后按下键盘，步美认出声音“是长笛。”
堂本弦也“管风琴演奏家会利用这些音色组合为演奏带来变化。”
光彦“原来如此，我又上了一课。”
苍天蓝羽“正好我给大家出一个问题，请问，美国人下象棋为什么百分百会输？”
众人“不知道。”
“因为他们开局就少了两座塔。”
柯南“911？”
“对。”
柯南：我就知道是地狱笑话……
“请问犹太人为什么不能当圣诞老人？”众人摇头。
“因为犹太人只能从烟囱出来。”
柯南：操……
高木警官找到秋庭伶子“不好意思秋庭小姐，可以跟你聊一聊吗？”
“真是的，时间应该不会太长吧？”
一段时间后目幕警官看着秋庭伶子“针对河边奏子小姐在爆炸前传给你的短信，我们有几点想要请教你。”
高木警官“我实在没办法和这些听不出音色差异的外行人合作，关于这条短信的意思……”
秋庭伶子“什么意思？就是字面上的意思，我之前也说过，我跟河边小姐是……”
佐藤警官“是在这次公演的记者会才第一次见面的是吧？”
“对，当时她跟我说她要去听已去世的那两个人的演奏，然后会把感想用短信发给我。”
白鸟警官“也就是说，那两个人跟河边小姐演奏出的音乐不同调，所有她不想跟那两个分辨不出音乐家所要表现的音色差异的人一同演奏是不是？”
“应该是吧，为什么不直接去问她本人呢？她不是恢复意识了吗？”
佐藤警官“意识虽然是恢复了，但是可能是爆炸造成的冲击，她并不记得案件前后的细节了。”
“是这样吗？”
白鸟警官拿出一截笛子“还有一件事，这个东西掉在案发现场。”
“是长笛的身管。”
“没错，头管，身管，尾管，这是长笛三个部分中，身管的部分。”
高木警官“其实也有可能是哪位学生忘了带走。”
毛利小五郎“不过，怎么可能会忘了带身管？”
目幕警官“你知道什么线索吗秋庭小姐？”
“没有，我不知道，你们问够了吧？”秋庭伶子回到观众席后拿出水壶。
元太问她“那是什么？你在喝什么？”
“喝茶。”
“也分一点给我喝嘛。”
“不行。”
“小气。”