于是，安室透运用自己的专业知识和先进的检测设备，对死者的组织样本进行了更深入的分析。经过一番艰苦的努力，终于在死者的血液中发现了一种极其微量的新型毒素。

柯南和灰原哀顺着这条线索，开始调查毒素的来源。他们发现，医院的药品供应渠道最近发生了一些变动，有一批新的药品供应商进入。经过深入调查，他们锁定了一名可疑人员，此人是新药品供应商的员工，曾有过犯罪前科。

警方迅速对该嫌疑人展开抓捕，并在他的住所搜出了制造毒素的工具和原料。原来，嫌疑人受雇于竞争对手的医院，企图通过在药品中添加毒素的方式，破坏这家医院的声誉。

在这起案件中，柯南、灰原哀与天才法医安室透紧密合作，成功揭开了真相。医院恢复了往日的秩序，而柯南和灰原哀也与安室透结下了深厚的友谊，他们知道，未来还会有更多的挑战等待着他们携手应对。

自此两人成立专门破悬案各种部门:第三重案组，成为日本东京警视厅特殊部队负责调查各种悬案抓捕和破解各种悬案寻找凶手，江户川柯南:每一场案子都拥有真相人性的弱点逐渐扭曲。新的挑战三人联手如何勘破悬案。